公媽牌、神主牌位、祖先牌位大致是同義詞；但「神主牌位」在治喪脈絡下也可能特指剛往生者的臨時個人牌位。往生牌位（為亡者）跟長生祿位（為生者祈福）用途相反。
公媽牌、神主牌位、祖先牌位，大致是同一件事
「公媽牌」「神主牌位」「祖先牌位」這幾個詞，在台灣民間習俗裡大致是同義詞，都指供奉家族歷代祖先的牌位。牌位分成「外牌」跟「內牌」：外牌通常寫「某姓歷代祖考妣之神位」（有些會加上堂號）；內牌則記錄個別祖先的稱謂、姓名、生卒日期，夫妻通常會寫進同一個內牌。
安置的地方傳統上是家中的祖龕、神明廳，或是宗祠；隨著現代家庭空間變化，也有不少家庭因為家中沒有適合的空間，把祖先牌位安置於寺廟或納骨塔的牌位區。
「神主牌位」這個詞，有歧義
「神主牌位」有時候就是祖先牌位的另一種說法，但在治喪的脈絡下，「神主牌位」也常常特指剛往生者的個人臨時牌位（也稱靈位、魂帛），跟代表家族歷代祖先、長期供奉的「祖先牌位」，其實是兩個不同階段的東西。
剛往生時，治喪期間會先設立這塊個人的神主牌位，寫上往生者的名諱、生卒年與稱謂，供家屬在治喪期間祭拜、寄託情感。等到對年或三年之後，通常會透過「合爐」儀式，把往生者的名字正式寫入祖先牌位（公媽牌）中，這時候他才正式成為家族祖先牌位裡的一員。
也就是說，同樣叫「神主牌位」，指的可能是「跟公媽牌一樣的東西」，也可能是「剛往生者的過渡期臨時牌位」，實際要看說話的脈絡跟時間點來判斷。
往生牌位 vs 長生祿位：用途完全相反
另外兩個容易搞混的詞是「往生牌位」跟「長生祿位」，尤其是到寺廟登記法會牌位時常見的混淆點：
往生牌位（也稱黃色蓮位）：是為已經過世的人設立的牌位，性質上屬於臨時性、法會期間使用。
長生祿位（也稱紅色祿位）：是為活著的人祈福迴向用的牌位，人還在世的時候就可以設立，即使當事人之後過世，供奉者通常仍會繼續祭拜。
這兩者用途完全相反，一個是為亡者、一個是為生者祈福，到寺廟登記法會牌位時，如果欄位寫錯，是常見的烏龍，建議先分清楚再登記，避免麻煩。
常見誤解
「神主牌位一定是指整個家族的祖先牌位」——不一定，在治喪脈絡下，神主牌位常特指剛往生者的個人臨時牌位，跟長期供奉的祖先牌位是不同階段。
「往生牌位跟長生祿位是同一種東西」——不是，往生牌位是為亡者設立，長生祿位是為活人祈福設立，用途完全相反。
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